Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PODXLO00592 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXLO00592 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXLO00592 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXLO00592 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PODXLO00592 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PODXLO00592 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PODXLO00592 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PODXLO00592 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PODXLO00592 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXLO00592 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXLO00592 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXLO00592 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXLO00592 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PODXLO00592 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PODXLO00592 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PODXLO00592 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXLO00592 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXLO00592 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXLO00592 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXLO00592 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXLO00592 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PODXLO00592 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXLO00592 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXLO00592 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXLO00592 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXLO00592 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXLO00592 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PODXLO00592 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PODXLO00592 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PODXLO00592 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PODXLO00592 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PODXLO00592 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PODXLO00592 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PODXLO00592 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PODXLO00592 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PODXLO00592 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PODXLO00592 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PODXLO00592 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PODXLO00592 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PODXLO00592 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PODXLO00592 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PODXLO00592 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PODXLO00592 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PODXLO00592 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PODXLO00592 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PODXLO00592 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PODXLO00592 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms