Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ELL2O00472 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ELL2O00472 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ELL2O00472 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ELL2O00472 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ELL2O00472 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ELL2O00472 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ELL2O00472 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ELL2O00472 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ELL2O00472 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ELL2O00472 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ELL2O00472 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ELL2O00472 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ELL2O00472 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ELL2O00472 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ELL2O00472 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ELL2O00472 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ELL2O00472 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ELL2O00472 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ELL2O00472 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ELL2O00472 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ELL2O00472 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ELL2O00472 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ELL2O00472 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ELL2O00472 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ELL2O00472 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ELL2O00472 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ELL2O00472 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ELL2O00472 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ELL2O00472 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ELL2O00472 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ELL2O00472 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ELL2O00472 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ELL2O00472 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELL2O00472 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELL2O00472 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELL2O00472 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELL2O00472 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELL2O00472 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELL2O00472 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELL2O00472 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELL2O00472 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELL2O00472 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELL2O00472 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELL2O00472 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELL2O00472 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELL2O00472 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELL2O00472 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ELL2O00472 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ELL2O00472 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ELL2O00472 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ELL2O00472 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ELL2O00472 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ELL2O00472 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ELL2O00472 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELL2O00472 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELL2O00472 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELL2O00472 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELL2O00472 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELL2O00472 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELL2O00472 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ELL2O00472 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELL2O00472 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms