Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GFRA2O00451 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFRA2O00451 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms