Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QR89 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QR89 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QR89 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3QR89 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3QR89 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3QR89 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3QR89 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QR89 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QR89 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QR89 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QR89 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QR89 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QR89 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QR89 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QR89 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QR89 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QR89 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms