Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QLW9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QLW9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QLW9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
J3QLW9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QLW9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QLW9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QLW9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QLW9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QLW9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QLW9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QLW9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QLW9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QLW9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QLW9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QLW9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QLW9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QLW9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QLW9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QLW9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QLW9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QLW9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QLW9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299 ms