Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8VRH5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8VRH5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F8VRH5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
F8VRH5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
F8VRH5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
F8VRH5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F8VRH5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F8VRH5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8VRH5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8VRH5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8VRH5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8VRH5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms