Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPIPB8E9PQR5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPIPB8E9PQR5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB8E9PQR5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms