Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf172C9J069 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms