Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVV-1B6SEH8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-1B6SEH8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms