Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DEV8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DEV8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B4DEV8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B4DEV8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
B4DEV8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
B4DEV8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
B4DEV8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
B4DEV8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
B4DEV8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
B4DEV8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B4DEV8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
B4DEV8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
B4DEV8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
B4DEV8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
B4DEV8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
B4DEV8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
B4DEV8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
B4DEV8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
B4DEV8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms