Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGB1P1B2RPK0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HMGB1P1B2RPK0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms