Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNCNA6PVL3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms