Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC10BA6NIK2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC10BA6NIK2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms