Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNDIG1LA6NDD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms