Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA6A0AVT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms