Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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