Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
YBX2Q9Y2T7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms