Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HPS5Q9UPZ3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms