Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms