Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms