Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms