Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PCNX1Q96RV3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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