Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COG3Q96JB2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms