Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms