Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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