Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID3BQ8IVW6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms