Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP31Q70CQ4 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP31Q70CQ4 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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