Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHYHD1Q5SRE7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.2 ms