Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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