Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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GABRA6Q16445 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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GABRA6Q16445 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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GABRA6Q16445 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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GABRA6Q16445 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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