Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms