Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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NEDD8Q15843 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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NEDD8Q15843 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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NEDD8Q15843 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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NEDD8Q15843 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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NEDD8Q15843 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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NEDD8Q15843 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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