Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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