Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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