Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD1Q15327 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms