Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APOFQ13790 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APOFQ13790 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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