Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABPAQ06546 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms