Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms