Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms