Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN10P78369 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms