Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMC1P62191 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms