Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms