Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms