Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PSMB4P28070 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms