Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms