Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRHP20396 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRHP20396 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRHP20396 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms