Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms