Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD58P19256 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD58P19256 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms