Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATF3P18847 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATF3P18847 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATF3P18847 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATF3P18847 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATF3P18847 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATF3P18847 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATF3P18847 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATF3P18847 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATF3P18847 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATF3P18847 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATF3P18847 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms