Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DESP17661 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms